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第22章 开源三维软件

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距离李旭等人将样本送往远景生化分子公司已过去快一周了。这段时间他时刻翘首以盼着实验结果的出炉。终于,这一天来临了!李旭接到了远景生化分子公司出结果的短信。

李旭按捺不住内心的激动,迅速打开电脑,登录远景生化分子公司的官方网站。点击进入客户数据页面后,他毫不犹豫地下载了那份近3Gb的生化大分子三维结构的数据。

由于这些数据实在太过庞大,所以整个下载过程变得无比漫长。面对如此状况,李旭也感到无可奈何,他只能选择暂时放弃等待,先去睡觉休息了。毕竟人不是机器,不可能一直保持活力四射的状态,而且长时间盯着电脑屏幕对眼睛和身体都不好。于是,李旭伸了个懒腰,活动了一下筋骨,然后便躺在床上闭上了双眼,进入了梦乡。

时光荏苒,已然来到了 12 月 31 日,明日便是元旦佳节,学校也将要放假。而就在今夜,校方精心筹备的元旦联欢晚会将会盛大举行。鉴于此前圣诞晚会的经验教训,此次晚会选择在大礼堂内举办。

夜幕降临,华灯初上,晚会即将拉开帷幕结束了一天课程的全校师生们开开心心地前往大礼堂。此时,黄彩英在大礼堂门口遇见谭少健,便走上前去关切地问道:“吃了水库里的鱼之后这两天,身体有没有感觉不适呢?”

“一点儿异样都没有啊,黄老师。”谭少健回答道。

这时,恰好路过的翟中和插嘴说道:“黄老师,你多虑啦。说不定只是那些人自身的体质问题罢了。我家小……”话至中途,翟中和猛然意识到自己差点说出翼龙幼崽的事情,于是急忙刹住话头,不再往下说了。

“你家小朋友也吃了?”黄彩英满脸疑惑。

“是啊,吃过,同样没出啥事。”翟中和话里有话,其实从情感上来讲,他早已将小翼龙视作自家孩子一般疼爱呵护。然而这番深意,黄彩英并未领悟到,她误以为对方口中所说的“小朋友”指代其亲生儿子。

于是乎,黄彩英瞪大双眼,难以置信地凝视着翟中和,追问道:“当真如此?”

“千真万确啊!”翟中和非常自信地回答。

得到肯定答复后的黄彩英如释重负,心中悬着的石头终于落了地。转而催促身旁的谭少健:“那好,少健你赶快进去找个位置坐下吧。”

学校的大礼堂被璀璨的灯光照亮,处处弥漫着欢快愉悦的气息。在全校师生满怀期待之下,元旦晚会终于盛大开幕。

绚丽多彩的灯光在舞台上交相辉映,如繁星点点,又似彩虹飞舞,营造出一幅热火朝天的画面。观众们沉浸在这片光影的海洋中,脸上洋溢着兴奋与喜悦。

伴随着热烈的掌声,主持人精神抖擞地登上舞台。他们面带微笑,眼神充满活力,以激昂的声音向全场师生致以最诚挚的问候。接着,主持人慷慨激昂地宣布:“元旦晚会现在正式开始!”话音刚落,现场顿时爆发出雷鸣般的欢呼声,将整个气氛推向高潮。

掌声渐息,传来的是一段激情澎湃、铿锵有力的朗诵,“故今日之责任,不在他人,而全在我少年。少年智则国智,少年富则国富;少年强则国强,少年独立则国独立;少年自由则国自由;少年进步则国进步”,瞬间点燃了全场的气氛。

接下来登场的是同年级另一个班级带来的精彩剧目——《孔雀东南飞》。当焦母的声音响起时,李旭立刻辨认出了这位扮演者正是他初中时期的同班同学马蓓旎。原来,她也在这所高中就读,但并未与李旭分在同一个班级。

只见台上的演员们全情投入,将角色演绎得淋漓尽致、活灵活现,令人仿佛置身于故事之中。同学们很快便被深深吸引,沉浸在剧情里无法自拔。

紧接着,舞台上出现了一部名为《四季群侠》的小品。剧中有四位性格迥异的学生,分别自称\"春花秋月冬虫夏草\"。他们因为各自喜爱不同的明星,而在班级里发生了一场争执。面对这种情况,老师并没有急于批评或指责,而是以温和且耐心的方式引导着他们要懂得求同存异,并告诉他们每个人都有权选择自己喜欢的事物。最终,在老师的悉心教诲下,这四位同学化解了矛盾,重新和好如初。整个小品情节生动有趣,充满了幽默和温情,赢得了台下观众阵阵热烈的掌声。

随后,一场场精彩纷呈的节目轮流登台亮相。

临近晚会末尾之际,全体演员齐声合唱了一首脍炙人口的经典老歌。那激昂豪迈的旋律在整个礼堂内久久回荡不息,使得现场原本就已经炽热无比的氛围再度升温至巅峰状态!

最终,在主持人诚挚恳切的谢幕辞中,本次元旦晚会画上了完美句点。他们向所有积极参与演出的师生表示衷心感谢,并送上最真挚美好的祝福:愿每个人在崭新的一年里都能够学有所成、收获满满,生活幸福美满、快乐无忧!伴随着如雷贯耳的热烈掌声,这场难忘的盛会正式落下帷幕。

曲终人散之际,喧嚣声逐渐消散,翟中和趁此机会不动声色地凑近李旭,压低声音向他打探道:“我想问问你,先前那潘氏鱼究竟是在哪儿被发现的呀?”面对询问,李旭也不藏着掖着,竹筒倒豆子般知无不言、言无不尽,将所有相关信息都一五一十地告知给了翟中和。

李旭缓缓地走进宿舍,他像往常一样轻轻地坐在椅子上。然后伸出右手,滑动鼠标,随着一阵轻微的电流声响起,电脑屏幕被成功激活亮起。

李旭定睛一看,发现之前下载的数据已经全部完成了。他那原本紧绷着的脸终于放松下来,嘴角也微微上扬露出一丝笑容。

数据文件采用 pdb(蛋白质数据库)格式,他熟练地使用两款开源软件——Jmol 和 pymol,将数据清晰地呈现为三维立体图像。此外,这两款软件还可以任意旋转三维立体图像,以便观察任意结构的细节。

打开数据文件后,李旭选择了自己最为熟悉的两种模式:卡通模式用于观察整体结构,卡通的展现手法让分子如动画中的精灵美仑美奂,可以更直观地了解大分子的全貌;而球棍模式则侧重于展示元素组成和原子间化学键,每个原子都被纤毫毕现地呈现出来。

当那些清晰明了的三维立体图像展现在眼前时,李旭对大分子结构就可以了然于心。他的心中顿时涌起一股无法言喻的喜悦之情。这些立体图像传达的信息是他和同学们努力的成果,凝聚着大量的辛勤付出。此刻,所有的汗水与坚持都得到了最美好的回报。

当谈到如何理解那些诸如坐标系、立体几何和大分子三维结构之类较为抽象的概念时,李旭心里很清楚,光看数据是远远不够的,还必须得展现出直观的模型才行。虽然,世界上也存在着那么一种天才,他们仅需通过数据、二维图像就能在自己的脑海当中成功地构筑出一个完整的三维立体图像来。只可惜,李旭心里明白,他并不是那样的天才。

对李旭而言,只有三维立体图像才能带来最直观的感受。其实这种情况,跟中国历史上学现代数学的时候非常相似,那时大家也觉得还是直观一点更好理解。而要说起这个,那就让李旭想到留学生给李鸿章讲抛物线的趣事。

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