随后便是陈群的九品中正制被袁耀正式采用。而且在此基础上，袁耀还将陈群的这项制度与后世的官员品级制度衔接。他不用九品中正制来给世家子弟评级，而是将其完全作为官员的级别分类。
从一到九，每个级别又分为正、从两级，一共九品十八级。
各部尚书、以及军师府祭酒、都督府大都督，均被任命为正二品，侍郎被定为正三品，各部下属各司长官为正四品。但袁耀下属的玄翎卫南北司司长、稽查司司长，低于其他各司司长的官衔，定为正五品，而兰台阁参议只有正六品。最低的便是各屯的堡长、守备官、民事官，都是从九品。
官员有了品级，自然便有了相应的俸禄和待遇，这也是袁耀试图建立一个真正能治理天下的官僚机构。
随后，袁耀颁布命令，由教政部尚书魏楷负责，在许都仿淮南学院、金陵学院建立新的中原学院。所有大汉子民，无论寒门出身还是世家子弟，均可考取三所学院的任何一所。考试内容五花八门，不仅有经史子集各家经典、更有军事、航海、工学、算学、农学、医学、天文地理学等其他科目。考试每三年一次，招收四十岁以下的考生、一些特殊科目女性也可参与。每个学院五百名学生，共计一千五百名，学制为三年。
此举是为了给天下所有能人志士一条稳定的上升通道，只要你有能力考上学院，并且从这三所学院任何一所毕业。大楚各部、地方各衙门，便会择优录取，一步成为大楚的基层官员。第一次考试便定在建安十六年七月，距离现在，还有九个月时间缓冲。这也是为了给天下英才一个准备、适应的机会。
当然，袁耀也没有忘记现有的淮南官员。每个学院考试时，都会专门增加两百名进修名额，三个学院共计六百人。这些名额主要给现有淮南基层官员学习、提高之用。各部、地方衙门、军队、都会择优选拔优秀人才加入学院深造。这些人不必考试，通过学习后便会进入上升通道。
考试将同时在许都、寿春、金陵、三处同时进行，由各学院祭酒负责主持。学生可自行选择备考学院，就近考试。但每个学院名额固定，人多竞争自然更加激烈，这便要求考生不仅有能力，还要有眼光和运气。
以上这些事的商讨、形成定论，便足足用了半个月时间方才最终敲定、公布。这是大楚立国的根本，关系到生产关系、官僚体系、人才选拔等重要内容，自然马虎不得。
接下来军事方面的会议便快速得多，因为相关内容都是秘密，自然不必过多讨论。参加会议的人也不多，除了中书省、都督府、兰台阁的众人之外，其他各军、各卫官员都未参加。现在依然是战争时期，这些一线指挥官自然要守在前线。
首先，自然还是编制问题。袁耀必须改制军队，使其更加适应现在规模的作战。
袁耀将原有的江东、淮北、淮南三镇重设更名为大楚第一镇、第二镇、第三镇，并新增设第四镇。作为最大的军事指挥机构，没有固定指挥的部队，而是根据自己所负责的区域进行统合作战，类似于后世的战区。而最大的军事单位实际为军，这些军都有自己的固定编制，一般不会进行拆分。
每镇下设数量不同的各军，每军下设相对固定的各卫、每卫下设四营，每营编制为五千。
军衔、军爵系统保持不变。镇的最高长官为总领，挂都督府都督衔。军的最高长官为卫将军、卫的最高长官为平将军、营的最高长官为中郎将。
第一镇大本营设立在南阳郡治宛城，主要的任务是防御曹魏武关方向、以及监视孙刘荆襄方向的动静。镇总领为左都督雷勇，下辖宣武军（驻宛城）、陆逊踏浪军（驻江夏）、邓晨归义军（驻南昌），总兵力达到十五万。
第二镇大本营设立在渤海郡郡治南皮，主要任务是进攻并州、并且配合袁复的十万冀州士族联军，围攻曹仁、曹洪盘踞在魏郡八万曹军。镇总领为左都督徐彬，下辖安旭飞燕军（驻常山国）、陈杰骁果军（驻平原郡）、徐朗胜捷军（驻东郡濮阳）。总兵力达到二十万，是袁耀最大的军事集团。而与曹军交战的正面战场，信都清河一线，袁耀则全部交给袁复的士族联军。
第三镇大本营设立在荥阳，主要任务是完全夺取河内郡，进攻上党郡，截断曹军在魏郡的后勤补给，巩固河内郡的安全。镇总领为右都督袁明，下辖新建侯晖丹翎军（原丹翎卫升格），卫明靖安军（原靖安卫升格）、黄漪汝阳卫、纪灵怀远卫、以及刚刚正式完成收编，臧霸的泰山卫，总计十五万人。
不得不说，臧霸这个人依旧十分的会审时度势。袁耀本许诺他继续出任青州刺史，掌握泰山郡。但曹操退守关中以后，臧霸便知道自己绝不可能长久独立存在于淮南体制之外，搞什么独立统治。于是便主动向袁耀上书，要求完全归附。袁耀也乐得其成，便将其部整编为一万人的泰山卫，交给了淮南镇总领。至此、整个黄河以南，南阳、江夏以东，已经全部成为大楚的领土。
第四镇大本营设立在金陵，主要的任务是统合江东百越，经营岭南七郡、维护秩序。镇总领为金陵学院祭酒兼岭南研究院祭酒卫向，他挂上了都督府右都督衔。下辖潘璋选锋卫、岭南研究院教导营、金陵学院教导营，总兵力三万。
另外还新设的都督府海军司，归袁耀直接统领。海军司司长为东莱商号甲二班魁首蔡谨。下辖东莱水军、广陵水军。袁耀将这两支新兴海军与东莱商号捆绑，便是希望用商业行为配合强大水军，进行海外领土和贸易的开拓。
重新整编下来，大楚虽然已经坐拥半壁江山，但扩军上依然相对保守。全国各镇加上中央禁军总共拥兵也不足六十万，在乱世，这已经是十分的克制了。
中原破败，各地入不敷出，需要恢复生产。袁耀不仅没有制定大规模的西进攻击计划，还希望尽量地精兵简政，使民休息。