时间过去了两年半，期间鸣人的生活平平淡淡，一如既往的被村民仇视和憎恨，每当鸣人表现出极度伤心和不满的时候，三代目就满脸慈祥的来看他。
这段时间里高层和宇智波暗流涌动，两方势力来回拉扯。
在宇智波想闹独立的第二年年初，宇智波鼬被三代目招入暗部，宇智波安静了下来。
两个月后，村子高层监视宇智波的动作由明转暗，但令团藏万万没想到的是，宇智波内部的鹰派和鸽派居然真的内耗了起来，因为宇智波鼬没有第一时间将村子加大了监视人手的情报传回族内，而且他本人也主动参与监视宇智波的任务。
宇智波两派的争斗持续了整整五个月，一个爆炸性的消息传遍了木叶——止水死了，直接将木叶高层引入两派之间的斗争，暂时压住了即将内部火并的宇智波一族，而宇智波也再次将发动政变这一行动提上了族会的议程。
随着三代目和团藏的一番默契配合，以及两年多来族人‘狭隘思想’和‘反动言论’，让宇智波鼬彻底疯了，认为族人不配以宇智波自居，这一届的宇智波无论男女老幼，全部都已经废了。
宇智波已经成了村子维持和平的威胁，只有什么都不懂的傻白甜弟弟——宇智波佐助例外，他才是重振宇智波威名的唯一希望！
………
木叶58年，4月9日，早上8点。
鸣人将昨天三代目送来的入学申请书折好放进口袋，拿上两块面包就出门了。
一如既往的跑酷式赶路，引得大街小巷中鸡飞狗跳，从家门口到学校门口，至少有三十多家摊位遭了殃，鸣人敢对灯发誓，绝对不是因为那些商贩骂了他父母而报复，这只是意外！
“老爸，止水那家伙恢复的怎么样了？”无视负责入学的教师的冰冷眼神，鸣人蹦跳着进入学院大门。
火之国西北边界附近，某个小村庄。
顶着大古样貌的水门倚门而坐的说道：“他的伤势完全恢复，身上的多种剧毒在昨天也已经被彻底清理干净，除了写轮眼，止水已经完全好了。”信息以无线电波的形式传输出去是数码生物的本能之一。
宅院的空地上，恢复如初的止水正在耐心的给一个红发小女孩喂招。
在鸣人强大的阳遁查克拉的滋养下，止水的身体保住了生机，空洞的眼眶也长出了眼睛，只等他再次开眼，然后夺回别天神之眼，他就能开启永恒的万花筒写轮眼。
而红发小女孩则是漩涡香磷，在水门获得数码之躯后，应玖辛奈的强烈要求，从草忍村悄无声息的带走了四岁的漩涡香磷和伤痕累累的漩涡冬美，把她们母女安置在了火之国边境附近的村子。
止水跳崖的那天，崖底下等待多日的鸣人父子救了他，水门就把他也送到了边境小村，一是选择个安静的地方给止水养伤，二是止水伤好以后可以保护冬美母女。
在暗部和三代目眼中，鸣人这两年半就是个普通的熊孩子，顶多再加个人柱力的身份，但鸣人悄悄积蓄的力量，却早已能惊艳所有人。
影分身和螺旋丸这两个忍术早已掌握，神乐心眼和金刚封锁也早已觉醒，玖辛奈亲手布置的隔绝结界遮挡住了鸣人的数码之力，查克拉倒是不用阻隔，谁不知道人柱力拥有查吨拉。
在鸣人身体过小的限制下，人型斗士的实力卡在了成熟期的极限，可他有传承自火神兽的综合格斗技，所以水门对他的战力评价是上忍级，而一旦鸣人借用九喇嘛一条尾巴的力量，那就只有卡卡西这一等级的精英上忍才有机会胜他。
另外，鸣人本身具有风属性的查克拉，因为与阿修罗查克拉融合后大幅提高了纯度，所以他顺利获得了第二个融合素材——风系斗士精神。
在光系斗士精神和火系斗士精神的影响下，白龙和黑龙这两年的成长速度不比鸣人慢多少，三大圣地中只有修炼了仙法的通灵兽才能与它们一战！
而说到仙法，那就不得不提拥有数码身躯的波风水门了，数码化助他打破了血脉限制，数码生物天生便能感应世界能量的本能，更是让水门摆脱了妙木山坑爹的仙人模式。
九喇嘛完整之后的当晚，水门笑呵呵地讨好狐狸哥，一番漂亮话就从狐狸哥那得到了海量的查克拉，然后水门将九尾查克拉统统转化为数码之力，为自己成功塑造了一副数码躯体，当灵魂和身体合一的那一刻，水门竟然获得了常态化的完美仙人模式。
一番推断和实验后，看完了“剧本”的三人一狐马上就明白了其中的缘由。
查克拉是怎么来的？神树掠夺世界能量所产生的另一种能量；
查克拉的组成是什么？掺杂着辉夜意志的精神力量和细胞力量；
大筒木辉夜和火影世界的世界意志是什么关系？掠夺者和被掠夺者；
修炼仙人模式需要吸收自然能量，当自然能量“看到”忍者体内含有辉夜意志的查克拉，它们会乖乖配合吗？就好像兔子对谁都是和和气气的，可他只要一看到脚盆鸡，兔子就会让世人知道，什么叫十世之仇，犹可报也！
没有了辉夜意志的查克拉，那就是自然能量的‘自己人’，虽然“样貌”不再，但查克拉终究是由自然能量改变而来，作为纯净查克拉的拥有者，水门和鸣人两父子为自然能量所青睐。
要不是鸣人受限于年龄，身体承受不了远超水门的海量自然能量，他也会拥有常态化的仙人模式！
现如今水门就是究极加强版的自来也，佩恩六道是吧？就算来一百个地爆天星，门师傅也能给你一个个搓爆！
………………
操场上一百多名新学员神采奕奕，他们已经听了三代目将近两小时的火之意志演讲。
二十来个忍族小孩的表情还算正常，其他平民学生就像是喝了十桶鸡血和十管鸡血，恨不得马上下一刻就能穿越回忍界大战期间，为木叶奉献自己渺小的生命。
‘猿飞日斩这老小子要去了地球，这不得是传笑组织的金牌讲师？牢饭就是他的铁饭碗，吃一辈子的那种！’鸣人面带亢奋以示尊敬，三代目比校领导厉害多了，他连续两小时口水喷溅，硬是没喝一口水。
好在例行的洗脑大会总算有时间限制，又过了十来分钟后，三代目终于说出了演讲的最后一句话：“树叶飞舞之处，火亦生生不息。火光将会继续照亮村子，并且让新生的树叶发芽。”
啪啪啪……
清脆的掌声送走了意犹未尽的三代目，五位班主任依次登上了发言台。